En marzo de 1962, en Valparaíso, inició sus actividades la carrera de Educación Física, en el marco del recién creado Instituto Pedagógico de la Universidad de Chile. Este hecho ubica a la carrera como la segunda fundada en el país, siendo su primer coordinador el destacado académico, Pedro Remis Creixell.
Posteriormente, en 1970, se crea el Departamento de Educación Física, Deportes y Recreación, dependiente del área de Humanidades de la Universidad de Chile. Su primer director fue el profesor Rodrigo Salazar Urrutia, cuando en 1973 dicho departamento pasa a depender de la Facultad de Educación y Letras de la Universidad de Chile.
En 1984, como producto de las transformaciones sociales y políticas de aquella época, el Departamento de Educación Física y Artes pasa a depender de la Academia Superior de Ciencias Pedagógicas, para un año después integrarse a la recién fundada Universidad de Playa Ancha de Ciencias de la Educación.
En 1986 se funda la Facultad de Educación Física de la Universidad, que constituye la primera de su índole a nivel nacional. Este logro histórico y visionario trajo consigo el reconocimiento de su autonomía académica y administrativa por parte de la universidad, y a su vez, el desafío y la oportunidad de definir su campo disciplinario como objeto de estudio.
En 1989 la Facultad de Educación Física se organiza administrativamente en dos departamentos: de Educación Física y el de Deportes y Recreación. En el año 2003 se crea una tercera unidad administrativa académica, el Departamento de Salud y Rehabilitación.
Durante estos años han sido cuatro los decanos que la han presidido: Nelly Orellana (1986-1990), Antonio Maurer (1990-1993, 1993-1996,1996-1999, 1999 -2001), Elías Marín (2001-2005) y César Oliva (2005-2008).
